1、软件的功能 CellChat主要可以做2部分工作: 1)受体-配体互作。CellChatDB包含人类和小鼠中具有文献支持的配体-受体互作关系,包括多聚体和辅酶因子; 2)细胞-细胞交流。根据scRNA-seq推...

牛掰花生 10-26 15 0

作者:一只想飞的喵 审稿:童蒙 编辑:angelica 箱线图是统计学中较常见的图形之一。这篇文章将讲述如何简单比较两组或多组的平均值,且添加显著性标记。 通常情况根据显著性p值的数值大小,...

牛掰花生 10-26 16 0

在进行组间比较的适合,我们常常会使用Venn图展示,常用的Venn R包有gplots、venneuler、VennDiagram等,但是都不怎么适合ggplot语法,现在有基于ggplot开发的ggVennDiagram和ggvenn包更适合...

牛掰花生 10-26 14 0

由reads count数计算TPM 和FPKM 下载gff文件http://venanciogroup.uenf.br/cgi-bin/gmax_atlas/download_by_pub.cgi去这里下载 reads count 数据 library("GenomicFeatures") library("dplyr...

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介绍ggplot2中facet_wrap( )函数中labeller 参数的用法 library(ggplot2) library(tibble) df > df # A tibble: 2 x 3 x y label ...

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转录组数据绕不过差异分析。 为什么选择这两个包呢? DEseq2针对有生物学重复的样本。(一般情况下应该是都需要生物学重复的) edgeR对于单个样本是比较好的。(但是细胞材料真的没办法,细...

牛掰花生 10-26 10 0

TCGA转录组数据 转录组数据的差异分析与芯片数据的差异分析有不同,这里我们使用count数据,因为这几种包中包装了标准化的函数,只需要程序化的输入两个数据,count矩阵和group数据,就能得...

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杀杀 生信分析中,我们在全基因组测序后会获得分子突变谱信息,如何直观地将各种疾病分子亚型下的基因突变特征,以及分子共突变/互斥突变的特征展示出来呢? 我们可以使用R语言中一个非常...

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欢迎大家关注我的公众号:一只勤奋的科研喵 文章来源:R语言|12. 森林图-1: 多因素Cox回归模型森林图 (基于forestplot包) 本期开始介绍Cox回归模型可视化。 之前学习过的的临床回归模型...

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欢迎大家关注我的公众号:一只勤奋的科研喵 亚组分析森林图 本期介绍使用R语言制作亚组分析三线表及其森林图。 注:由于未能找到专门做亚组分析的包或相关代码,本期代码是小编根...

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鱼翔浅底,鹰击长空,驼走大漠
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