软件介绍 听名字就可以猜出来Mitofinder是一个专门用于组装线粒体基因组的软件,该软件运行于liunx平台,不仅可以用于组装线粒体的基因组还可以用于注释线粒体基因组,不过需要一个近缘种的...

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拷贝数变异 拷贝数变异(Copy number variation, CNV)是由基因组发生重排而导致的, 一般指长度为1 kb 以上的基因。 目录 1 概念 2 研究方法 概念 [编辑](javascript:;) 拷贝数变异(Copy n...

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Mummer详细介绍转至参考:https://www.jianshu.com/p/2e184e5c15b7https://www.jianshu.com/p/c12f2a117892https://wenku.baidu.com/view/ba1f0dd452d380eb63946d3e.html?fr=search-1-wk_es_p...

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作者:马可菠萝 审稿:童蒙 编辑:angelica 随着基因测序上游技术的变革,DNA测序已经迈入了单分子测序的时代,最具代表性的非PacBio和ONT莫属。那么二者又有哪些优劣势、异同点呢, 且看下...

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wtdbg2软件下载与安装 git clone https://github.com/ruanjue/wtdbg2 cd wtdbg2 make 进行基因组装 第一步是组装 第二步是得到一致性序列 #! /bin/sh ~/usr/wtdbg2-master/wtdbg2 -t 16 -...

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SSR (Simple Sequence Repeat),即简单重复序列,是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,也称为微卫星序列或者串联重复。 简单重复顾名思义就是以很短的序列为一个单元,比如5个碱基(A...

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转载自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw 背景 选择清除分析是常用于鉴定群体基因组水平受选择区域的一种方法,其背后的理论是:在受选择群体中,会出现有利等位基因的频率...

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mVISTA可对2个或者多个DNA序列进行比较,可以比照对结果进行可视化。 详情请大力戳这里 0 输入文件说明 mVISTA 需要输入的文件有如下几类 必须文件 邮箱 fasta格式序列文件(或者GENBANK ...

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网址https://asia.ensembl.org/index.html Ensembl是一个脊椎动物基因组的基因组浏览器,支持比较基因组学、进化、序列变异和转录调控的研究。Ensembl注解基因,计算多种校准,预测调节功能...

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最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送,发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念,前者主要是基于蛋白水平,蛋白的保守性很高,即...

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鱼翔浅底,鹰击长空,驼走大漠
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